工业运行是工业经济研究所长期关注和研究的重点领域，很多学者积累了大量有价值的成果。2009年，为加强与工业主管部门合作，促进对工业运行问题的系统研究，正式成立了工业运行研究室。研究室自成立以来得到了所领导的高度重视和大力支持，经过几年的发展，目前研究室已经与工信部等工业主管部门建立了长期稳定的合作关系，在工业运行形势分析、产业政策评估等研究领域取得了积极的进展。研究室提交的研究报告，多次得到国家高层领导的批示，很多研究成果在社会上取得了较大反响。
自2009年开始，研究室每季度与工业和信息化部运行局联合发布《中国工业经济运行形势分析报告》，产生较大的社会影响。2009年-2011年期间，受工业和信息化部委托，组织所内专家对重点产业调整振兴规划的实施情况进行跟踪评估，形成了《重点产业调整振兴规划评估报告》，得到了社会各层面的高度评价。承担了国家科技支撑计划课题“跨区域经济发展动态模拟仿真技术研究”，开发动态CGE模型，建立数据库系统，并用于政策分析和产业分析。每年定期发布《中国企业竞争力报告》（金碚主编）和《中国产业竞争力报告》（张其仔主编），对中国企业和产业发展情况进行监测分析。
研究室主要围绕工业运行形势分析，重点研究工业运行中面临的一些突出问题，评价工业运行的质量和效益，分析国家产业政策对工业运行的影响。主要包括以下重点研究领域。
1. 工业经济运行的监测与预警。开发能够用于工业运行形势分析的模型和数据库，对工业运行进行预测分析，及时对工业运行中存在的风险进行预警。
2. 对工业运行的质量和效益进行评价。评价不同地区、不同产业的运行情况，研究制约工业运行质量和效益提高的关键因素和突出问题。
3. 分析产业政策对工业运行的影响。对国家产业政策的实施情况进行评估，提出产业政策调整的政策建议。
4. 产业竞争力分析。对中国和主要经济体的产业竞争力进行跟踪、分析、评价，对地区产业竞争力态势进行预警和监测。
1. 在职研究人员
金碚，学科带头人，学部委员，研究员，博士生导师，所长
张其仔，学科带头人，研究员，博士生导师，所长助理，集团联络处处长
原磊，研究室副主任，副研究员，经济学博士
刘昶，助理研究员，管理学博士
张航燕，助理研究员，管理学博士
2. 在站博士后
谭运嘉
金碚，《中国工业国际竞争力－理论、方法与实证研究》，经济管理出版社，1997年；
金碚，《产业组织经济学》，经济管理出版社，1999年10月；
金碚，《竞争力经济学》，广东经济出版社，2003年5月；
金碚，《竞争秩序与竞争政策》，社科文献出版社，2005年9月出版；
金碚，《资源环境管制与工业竞争力》，经济管理出版社，2010年4月；
金碚，《中国企业竞争力报告》（2003-2011），社科文献出版社，2003年-2011年；
张其仔，《模块化、产业内分工与经济增长方式转变》，社科文献出版社，2008年10月；
张其仔，《中国产业竞争力报告》（2010，2012），社科文献出版社，2010-2011年；
张航燕，《中国自然垄断产业改革的产权模式研究》，经济管理出版社，2010年8月。
中国社会科学院工业经济研究所工业运行课题组，《2011年中国工业经济运行形势展望》2010年第3期；
金碚，《国际金融危机下的中国工业》，《中国工业经济》2010年第7期；
金碚、原磊，《德国金融危机救援行动的评析及对中国的启示》，《中国工业经济》2009年第7期；
金碚，《国际金融危机与中国工业化形势》，《人民日报》2009年6月22日理论版；
金碚、史丹、原磊，《当前宏观经济调控需要平衡的六大关系》，《中国企业报》2009年9月18日；
张其仔、郭朝先、白玫，《协调保增长与转变经济增长方式关系的产业政策研究》，《中国工业经济》2009年第3期；
张其仔，《比较优势演化与中国产业升级路径的选择》，《中国工业经济》，2008年第10期；
原磊，《重点产业调整振兴规划评估与展望》，《中国投资》2011年第7期；
原磊、邱霞，《三大财富平衡与中国产业发展》，《中国工业经济》2010年第2期；
原磊，《传统产业的绿色转型》，《人民日报》2011年10月17日国际版；
原磊，《新一轮繁荣和主导产业》，《人民日报》2010年8月18日国际版。
工信部委托课题“中国工业经济运行形势分析”（金碚主持）；
社科基金重大课题“产业竞争优势转型战略与全球分工模式的演变”（金碚主持）；
国家发改委和科技部《2012年中华人民共和国可持续发展国家报告》专题项目“中国经济转型发展及能源进展研究”（张其仔主持）；
社科院重大项目“我国产业竞争优势转型及其风险研究”（张其仔主持）；
社科基金青年项目“商业模式与企业创新研究”（原磊主持）；
所重点课题“工业运行形势分析框架研究”（原磊主持）。
